合理选用药物是畜牧兽医工作的一个重要问题，用药不当或滥用药物，不仅不能治疗畜禽疾病，而且还可能造成不良后果，因此应注意合理选用药物和使用药物。
治疗某种疾病，常有数种药物可以采用，但究竟采用哪一种最为恰当，可根据以下几个方面考虑决定：
（1）疗效好
为了尽快治愈疾病，应选择疗效好的药物。如治疗幼畜下痢，则四环素、氨苄青霉素、黄连素都可采用。
（2）不良反应小
有的药物疗效虽好，但毒副作用严重，选药时不得不放弃，而改用疗效虽稍差但毒副作用较小的药物。例如可待因止咳效果很好，但因有成瘾与抑制呼吸等副作用，所以除非必需，一般不用。
（3）价廉易得
动物是有一定经济价值的，治疗动物疾病，必须精打细算，选择那些疗效确实，又价廉易得的药物。例如用磺胺类治疗全身感染，多选用磺胺嘧啶，少用磺胺甲基异恶唑。
