首先，要注意增施速效氮肥禾本科作物秸秆含纤维素较高，还田后土壤中碳素物质会陡增。而微生物的增长是以碳素为能源、以氮素为营养的，微生物必须从土壤中吸取氮素以补不足。一般来说，小麦秸秆还田后每亩应增施尿素30公斤或碳酸氢铵50公斤，满足秸秆分解所需。

其次，要注意翻压覆盖一般来说，在作物收获后就应立即把秸秆翻耕入土，避免因秸秆被晒干而影响腐熟速度，最好边收边耕埋翻压。

最后，要注意防治病虫害一般条件下，秸秆还田后病虫害有加重发生的趋势。秸秆中的病原菌和虫卵等，也会进入土壤中，增加下一茬作物受害的几率。所以，在将秸秆施入土壤前，可用百菌清500倍混加辛硫磷1000倍将秸秆喷洒一遍，以减少病原菌和虫卵的为害。